La instalación desatendida la creé con el nlite, una maravilla de programa http://www.nliteos.com/
Y lo de instalar aplicaciones lo hago con le uso de las carpetas $OEM$ y el RunOnEx.cmd (o algo asi) y los parámetros que casi todos los instaladores tienen como /s /S /q /Silent /Verysilent para que no pregunten nada,se instalan con las opciones típicas. Para registrar las aplicaciones,introduces una clave de registrocon el nombre/serial y a correr
Después con un bat quiero ajustar los parámteros de windows y poco más (estoy en esta última fase)